La caractérisation systématique du microbiote tout au long du tractus digestif équin est un enjeu majeur pour la compréhension des troubles métaboliques et inflammatoires. Une étude publiée en 2024 par raspa et ses collaborateurs apporte un éclairage sur la réponse microbienne différentielle à deux régimes contrastés : une ration riche en fibres (HF - high-fiber) et une ration riche en amidon (HS - high-starch). - - Méthodologie et cadre de l'étude - - L’étude a porté sur 19 chevaux, homogènes en âge et en race, nourris pendant 129 jours avec l'un des deux régimes. les chercheurs ont utilisé le séquençage d'amplicons de l'arnr 16s (16S rRNA amplicon sequencing) pour analyser des échantillons prélevés dans huit compartiments distincts du tractus intestinal après l'abattage. Cette approche a permis de cartographier les niches écologiques spécifiques allant du duodénum au rectum. - - Diversité microbienne et stabilité de l'écosystème - - L’un des résultats les plus significatifs concerne la diversité alpha (alpha diversity), indicateur de la richesse et de l'équitabilité des espèces au sein d'un échantillon. - - - - Les indices de diversité alpha (chao1, shannon et richesse observée) étaient significativement plus élevés dans le cæcum (caecum), la courbure pelvienne (pelvic flexure) et le côlon dorsal droit (right dorsal colon) chez les chevaux du groupe riche en fibres (HF). - - Une diversité bactérienne élevée est cliniquement associée à une plus grande stabilité du microbiote et à une meilleure résistance à la colonisation par des bactéries pathogènes (colonization resistance). - - À l'inverse, le régime riche en amidon (HS) a entraîné une réduction de la taille de la communauté bactérienne centrale (core bacterial community) dans l'intestin postérieur. - - - - Altérations taxonomiques induites par l'amidon (HS) - - Le régime HS, dépassant la recommandation de 1 gramme d'amidon/kg de poids corporel/repas, a induit des changements taxonomiques marqués associés à des risques sanitaires : - - - - Intestin grêle : une abondance relative plus élevée de proteobacteria, et plus spécifiquement d'enterobacteriaceae, a été observée dans le jéjunum et l'iléon. Cette famille comprend des pathogènes tels que escherichia coli et salmonella spp., pouvant compromettre la barrière intestinale et induire une condition d'intestin perméable (leaky gut). - - Intestin postérieur : le groupe HS a montré une prévalence accrue de streptococcus dans le cæcum et de fusobacterium dans la courbure sternale (sternal flexure), deux genres pro-inflammatoires associés aux colites et aux diarrhées. - - Bactéries amylolytiques : une augmentation significative des succinivibrionaceae a été notée dans la courbure pelvienne et le rectum, traduisant la présence d'amidon non digéré atteignant le gros intestin. Ces bactéries sont étroitement liées aux phénomènes d'acidose fermentaire. - - - - Bénéfices physiologiques de la nutrition fibreuse (HF) - - Le régime riche en fibres favorise le maintien d'une population microbienne physiologique et protectrice : - - - - Fermentation cellulosique : les chevaux HF présentaient des fréquences plus élevées de fibrobacteraceae et de prevotellaceae (notamment les genres fibrobacter et prevotella) dans le cæcum et la courbure sternale. - - Intégrité de la muqueuse : une présence accrue d'akkermansia a été identifiée dans le côlon dorsal droit du groupe HF. ce genre dégrade la mucine, jouant un rôle crucial dans le maintien de l'intégrité de la couche de mucus de la barrière intestinale. - - Santé rectale : les fèces du groupe HF montraient une plus grande abondance de lachnospiraceae et de ruminococcaceae, piliers de la communauté centrale intestinale équine. - - - - Conclusions cliniques et perspectives vétérinaires - - Cette recherche démontre à nouveau que le régime riche en amidon (HS) induit non seulement une dysbiose, mais provoque également une inflammation histologique, particulièrement dans le jéjunum et la courbure pelvienne. Les chevaux du groupe HS produisaient par ailleurs des excréments mal formés, signe clinique d'un environnement intestinal perturbé. - - Pour le praticien vétérinaire, ces données confirment que la promotion de régimes fibreux est impérative pour prévenir les déséquilibres du microbiote. Enfin, l'étude souligne que l'analyse seule du microbiote fécal peut être insuffisante pour refléter les changements microbiens complexes survenant dans les compartiments proximaux du tractus digestif. Le vétérinaire demeure le seul professionnel compétent pour interpréter ces analyses et diagnostiquer une pathologie digestive sous-jacente. - - Raspa F, Chessa S, Bergero D, Sacchi P, Ferrocino I, Cocolin L, Corvaglia MR, Moretti R, Cavallini D and Valle E (2024) Microbiota characterization throughout the digestive tract of horses fed a high-fiber vs. a high-starch diet. Front. Vet. Sci. 11:1386135. doi: 10.3389/fvets.2024.1386135
![[Publication scientifique] Impact d’une nutrition riche en fibres ou en amidon sur le microbiote du cheval](userfiles/news/293/info_veterinaire_-impact_nutrition_fibres_amidon_6992fac09200a.jpg?width=1920 "[Publication scientifique] Impact d’une nutrition riche en fibres ou en amidon sur le microbiote du cheval")